Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NBPF8Q3BBV2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF8Q3BBV2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms