Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms