Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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