Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ECM1Q16610 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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ECM1Q16610 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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