Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SSX1Q16384 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms