Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS72Q15906 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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VPS72Q15906 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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VPS72Q15906 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS72Q15906 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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