Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP6AP1Q15904 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms