Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC85BQ15834 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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