Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCOA1Q15788 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
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