Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms