Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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TRIP10Q15642 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIP10Q15642 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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