Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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IRF4Q15306 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IRF4Q15306 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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