Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRKQ15262 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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