Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GAPVD1Q14C86 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GAPVD1Q14C86 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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