Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL19A1Q14993 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COL19A1Q14993 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms