Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM25Q14258 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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