Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.8 ms