Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IKBKEQ14164 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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