Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms