Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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CAPSQ13938 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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CAPSQ13938 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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CAPSQ13938 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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CAPSQ13938 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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CAPSQ13938 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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CAPSQ13938 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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CAPSQ13938 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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CAPSQ13938 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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CAPSQ13938 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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