Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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