Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBA3CQ13748 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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