Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf61Q13536 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms