Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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