Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHAF1AQ13111 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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