Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NPRL3Q12980 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms