Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
STX4Q12846 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
STX4Q12846 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
STX4Q12846 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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STX4Q12846 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
STX4Q12846 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
STX4Q12846 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
STX4Q12846 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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