Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TROQ12816 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TROQ12816 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TROQ12816 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TROQ12816 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TROQ12816 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TROQ12816 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TROQ12816 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TROQ12816 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TROQ12816 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TROQ12816 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TROQ12816 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TROQ12816 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
TROQ12816 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
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