Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RASGEF1BQ0VAM2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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