Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
POLEQ07864 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
POLEQ07864 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
POLEQ07864 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
POLEQ07864 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
POLEQ07864 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
POLEQ07864 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
POLEQ07864 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms