Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD51Q06609 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms