Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms