Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms