Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPN12Q05209 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPN12Q05209 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms