Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F1Q01094 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms