Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SPTBN1Q01082 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms