Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MDM2Q00987 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms