Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAE1P78406 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAE1P78406 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAE1P78406 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms