Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TPTEP56180 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TPTEP56180 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms