Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB1P54762 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms