Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAD23AP54725 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms