Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSEN1P49768 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms