Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSNK1EP49674 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSNK1EP49674 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms