Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRPC1P48995 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms