Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
XCR1P46094 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCR1P46094 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCR1P46094 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCR1P46094 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCR1P46094 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCR1P46094 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCR1P46094 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
XCR1P46094 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCR1P46094 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XCR1P46094 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms