Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MDH1P40925 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MDH1P40925 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MDH1P40925 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MDH1P40925 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MDH1P40925 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MDH1P40925 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MDH1P40925 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MDH1P40925 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MDH1P40925 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MDH1P40925 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MDH1P40925 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms