Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MLH1P40692 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MLH1P40692 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MLH1P40692 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms