Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ARL1P40616 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARL1P40616 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ARL1P40616 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARL1P40616 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms