Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GGCXP38435 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GGCXP38435 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GGCXP38435 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms