Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RYKP34925 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RYKP34925 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RYKP34925 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms